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三分快三注册2023-01-31 16:05

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提速近10倍!基于深度学习的全基因组选择新方法来了******

  近日,中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用,将助力深度学习在全基因组选择中的应用,为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物(Molecular Plant)》上。

  全基因组选择作为新一代育种技术,通过构建预测模型,根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择,从而缩短育种世代间隔,加快育种进程,节约成本,推动现代育种向精准化和高效化方向发展。

  统计模型作为全基因组选择的核心,极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型,难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。

  相较于传统模型,非线性模型(如深度网络神经)具备分析复杂非加性效应的能力,人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机,深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。

  该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料,通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。

  与其他五种主流预测方法相比,该方法有以下优点: 可以利用多组学数据开展全基因组预测;算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构,可以有效降低模型错误率,提高运行速度;预测精度稳健,在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当,在大规模数据集上预测优势更加明显;计算时间与传统方法相近,比已有深度学习方法提速近10倍;超参数调整对用户更加友好。

  该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。

学术支持

中国农业科学院作物科学研究所

记者

宋雅娟

 

北京燃气天津南港LNG应急储备项目配套码头工程竣工******

  中新网天津1月12日电 (王在御)记者12日从中交一航局获悉,北京燃气天津南港LNG应急储备项目码头工程于11日完成竣工验收,工程施工质量及管理得到竣工验收组专家一致认可。

  据了解,中交一航局一公司参建的北京燃气天津南港LNG应急储备项目配套码头工程,包括新建15万总吨级LNG码头泊位1个,最大可靠泊26.6万立方米LNG船舶,设计年接卸能力500万吨;新建工作船码头1座,用于停靠3000吨级甲板驳和配备的工作船。项目还配套建设了护岸加固改造、港作船舶导助航设施等。2021年,该项目被交通运输部列为首批平安百年品质工程创建示范项目,是天津市唯一获此殊荣的在建水工项目。

北京燃气天津南港LNG应急储备项目码头工程于11日完成竣工验收。 中交一航局供图北京燃气天津南港LNG应急储备项目码头工程于11日完成竣工验收。 中交一航局供图

  此前,该项目分别于2022年9月30日与2022年12月21日两批次通过交工验收,标志着公司参建的北燃LNG码头工程全部完成。

北京燃气天津南港LNG应急储备项目码头工程于11日完成竣工验收。 中交一航局供图北京燃气天津南港LNG应急储备项目码头工程于11日完成竣工验收。 中交一航局供图

  据悉,该项目建成后,将提升北京市天然气储气调峰和应急安保供应能力,进一步推动京津冀地区协同发展和区域能源低碳化转型。(完)

中国网客户端

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